本院於設立宣教士專業學位時，特意採用「跨文化宣教」（Cross-Cultural Missions）替代潮流之「跨文化研究」（Intercultural Studies）一詞，旨在彰顯課程設計以聖經真理與神學思想為核心，非單純文化分析及溝通技能。在實習安排上，學院特別強調課堂所學與現場實踐的有機結合。學生規劃實習時，須根據課堂理論內容，主動投入跨文化場境，親身體驗並操練長期宣教所需之適應力與問題解決能力。透過真實的族群互動與反思，學員能逐步養成跨文化敏銳度、謙卑服事的僕人心志，並汲取處境化牧養及宣教的寶貴經驗。

除宣教專業學位之外，恩福神學院亦要求所有道學碩士（MDiv）及神學學士（BTh）學生修讀宣教學科目。這樣，將來服事教會的牧者亦具備寬廣的普世宣教視野與使命感；藉此深化他們對教會宣教使命擁有整全性的認識，引領各地教會積極參與於上帝普世救贖工程。

恩福神學院堅信，紮實的聖經根基乃跨文化宣教教育之始；健全的神學建構與理論應用，使學生能直面時代與文化的挑戰。在課程設計、實踐訓練及全人裝備之整合努力下，學院致力於培養能以生命回應呼召、具跨文化洞見與過人適應力，且能持久委身於神國宣教之牧者與宣教士。這正是本院一以貫之的辦學使命與榮神益人之追求。